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Nacio el equipo de barrio en un potrero del barrio Buenos Aires al Centro- Oriente de Medellin con el nombre de Union Fc.
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Se consolido el nacimiento de la nueva institucion bajo el nombre de Club Atletico Municipal de Medellin.
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Fundadores: Julio Ortiz, Jorge Osorio Cadavid, Jorge Gómez, Arturo Torres, Gilberto Molina, Alberto Eastman, Raúl Zapata Lotero, Luís Alberto Villegas Lopera. Primera nomina: Carlos Pulgarín, Jairo Ramírez, Gabriel Osorio, Mario Sánchez, Eduardo “Guty” Amaya, Gustavo Mesa, Carlos Vivares, León Ortíz, Darío Gómez, Emilio Guerra, Guillermo Echavarría y Uriel Ríos.
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El nombre del equipo es cambiado por el de Atletico Nacional. Esta decisión se tomó teniendo en cuenta que el equipo contaba con jugadores de todo el país y que ésta denominación seguía más de cerca el lema adoptado por la institución desde su fundación oficial, “Por encima de todo la defensa y estimulo del jugador nacional”. Sin embargo el nuevo nombre no aparecería en las planillas oficiales de la Dimayor sino hasta la temporada siguiente.
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Por primera vez en su historia Nacional obtuvo su primer titulo Bajo la direccion tecnica de Fernando Paternoster,
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Son once extrellas las q a logrado Atletico Nacional aparte de grandes triunfos
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Se obtiene el segundo titulo en Atletico Nacional con el tecnico Paraguayo César López Fretes.
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Fue un gran año en el fútbol y en lo institucional; Aparte de haber ganado el tercer titulo la Gobernación de Antioquia lo condecoró la Condecoración Estrella de Antioquia en la categoría de Oro, el más alto y honroso reconocimiento que realiza el Departamento.
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En 1981 Nacional obtiene su cuarto titulo con Oswaldo Juan Zubeldía commo tecnico quien al año siguiente muere por un infarto.
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Ya en la final el primer partido se jugó en Paraguay, frente al Olimpia el 24 de mayo. Ganaron los paraguayos por 2:0. El de vuelta se jugó en Bogotá, en el estadio Nemesio Camacho, el Campín, debido a que el Estadio Atanasio Girardot, de Medellín, en esa época no poseía la capacidad mínima (50.000) que pedía la CONMEBOL. El juego finalizó 2:0 a favor de Atlético Nacional, teniendo que definir la copa por penales. Atlético Nacional se impuso 5:4, ganando así su primera Copa Libertadores de Améri
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Se jugó el 17 de diciembre de 1989. El Milán encontró en Nacional un rival muy duro. 2o lugar.
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La Copa Interamericana se realizaba un año después entre el ganador de la Copa Libertadores de América y el ganador de la Copa de Campeones de la CONCACAF. Donde sale Atletico Nacional campeon.
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Atletico Nacional obtiene su quinto titulo a pesar de que se encontraba en participaciones en la copa libertadores.
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Después de ser primero en la reclasificación, en los cuadrangulares semifinales le correspondió jugar con el Medellín, Envigado y el Deportivo Cali, ganando el grupo con 10 puntos. En el cuadrangular final le correspondió con Millonarios, América de Cali y el Medellín. El último enfrentamiento con su rival de patio, le dio el título, con gol de Juan Pablo Ángel.
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En 1995 Atletico Nacional queda subcampeon con un buen juego de cancha.
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El 3 de abril del año 1997 se enfrentaron Deportivo Saprissa y Atlético Nacional en un único partido en la casa del rival, dejando como ganador al verde 3-2.
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Se jugó por primera vez en 1998 y fue el reemplazo de la Copa Conmebol, aunque partida en dos: Merconorte y Mercosur. Donde Nacional sale Campeon nuevamente en Copa Mercanorte.
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Nacional gana bajo la direccion tecnica al inicio del torneo de Reinaldo Merlo pero luego lo cambian por Luis Fernando Suárez. Donde gana Atletico Nacional.
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En este año Nacional se coronó nuevamente como campeón de la Copa Merconorte, esta vez contra uno de sus rivales, Millonarios de Bogotá.
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En esta copa Atletico Nacional queda subcampeon con buenas estadisticas.
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Sus resultados fueron: frente al Cali: 0:0 y 1:2, Frente al DIM: 1:2 y 2:1 Frente a Tolima: 4:1 y 1:1, llegando a la final con 14 puntos, para enfrentarse a Santa Fe en la que empataron a 0 en la ida en El Campin y con victoria para el Verde 2:0 en el Atanasio Girardot.
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El director tecnico Oscar Quintabani fue con quien Atletico Nacional logro un Bicampeonato en el año 2007 gNando su noveno y decimo titulo.
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Atletico Nacional es campeon por decima ves y cosigue su primer bicampeonato.
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Atletico Nacional Obtiene su ultima extrella en el 2011.
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En la actualidad Atletico Nacional se considera y se le a otorgado el nombre de "Rey de copas" ya que sin duda es el mejor equipo de Colombia- las estadisticas y titulos lo demuestran.
